Геологический период под названием Пермский охватывает жизнь, существовавшую в регионе 650 миллионов лет назад. В музее пермских древностей собраны ископаемые представители флоры, фауны и геологические объекты. Музей древностей открыт в 2011 году как филиал краеведческого.
Коллекция разделена на пять групп. Животный мир пермского периода представлен реконструированными скелетами ящеров. Более поздние эпохи — динозаврами и мамонтами. В палеоботанической экспозиции собраны окаменевшие остатки и отпечатки растений, раковин и морских обитателей. Среди геологических объектов — минералы, кристаллы кварца, самоцветы, металлические руды, пермская нефть. Необычный экспонат — осколок Оханского метеорита.
Для детей дошкольного возраста проводятся экскурсии в игровом формате. Младшие школьники с удовольствием принимают участие в уроках-исследованиях и театрализованных экскурсиях. Для взрослых работает лекторий и научные мастерские.