В санатории «Магадан» есть большой крытый бассейн с двумя мини-бассейнами с горячей и холодной водой, а также двумя бассейнами с гидромассажем и водопадом. Посетители могут наслаждаться водными массажерами и приятной музыкой в прохладную весеннюю погоду. Кроме того, в бассейне есть сауна, которая оплачивается дополнительно.